هدف سازمان حفظ و حمايت، احياء، توسعه و بهره‌برداري اصولي از جنگل‌ها، مراتع، اراضي جنگلي، بيشه‌هاي طبيعي، اراضي مستحدثه ساحلي، حفاظت‌ و حمايت از آب و خاك كشور از طريق مديريت علمي بر حوزه‌هاي آبخيز و رعايت اصول توسعه پايدار 

وظايف سازمان

1. تدوين سياست‌ها و راهبردهاي بخش منابع طبيعي و آبخيزداري و تنظيم و اجراي برنامه‌هاي توسعه منابع طبيعي و آبخیزداری در چهارچوب سياست‌هاي توسعه پايدار

2. حفظ، حمايت،حراست و بهره برداري اصولي از جنگل‌ها، مراتع و بيابان‌ها و حوزه‌های آبخیز كشور

3.  تشخيص و تفكيك حريم قانوني اراضي ملي از مستثنيات اشخاص حقيقي و حقوقي و تثبيت‌ حاكميت دولت بر منابع ملي كشور

4. بررسي و مطالعه حوزه‌هاي آبخيز كشور به منظور برنامه‌ريزي و تهيه طرح‌هاي جامع و اجراي فعاليت‌هاي منابع طبيعي و آبخيزداري در حوزه‌های آبخیز کشور

5. توسعه جنگل‌ها و مراتع دست كاشت، پارك‌هاي جنگلي،اصلاح و احياء جنگل‌ها و مراتع مخروبه و ترويج زراعت چوب با تأكيد بر حفظ ذخاير ژنتيكي و تنوع زيستي گياهي

6. مطالعه و برنامه‌ريزي مناسب جهت افزايش بهره‌ وري در فعاليت‌هاي اجرايي

7. مطالعه، طراحي و بهينه‌سازي الگوها و نظام‌هاي توليد وبهره‌برداري در زمينه منابع طبيعي و آبخيزداري با استفاده از دانش بومي و تجربيات جهاني

8. جلب مشاركت اشخاص حقيقي و حقوقي در اجراي فعاليت‌هاي منابع طبيعي و آبخيزداري

9. تدوين، اجرا و به هنگام سازي نظام اطلاع رساني منابع طبيعي و آبخيزداري كشور جهت ارتقاء دانش عمومي و ترويج فرهنگ منابع طبيعي

10. مطالعه و برنامه ريزي جهت توسعه مديريت و سرمايه انساني سازمان به منظور ارتقاء بهره‌وري و اثربخشي